A estratégia operacional do GEF recomenda o uso de uma série de instrumentos para facilitar a participação dos países em projectos que adoptam uma abordagem integrada para a gestão dos recursos terrestres e marinhos. Um desses instrumentos é a Análise Diagnóstica Transfronteiriça (TDA), uma avaliação com uma base científica que identifica e quantifica as causas dos problemas ambientais numa região geográfica. A TDA toma em conta factores nacionais, regionais e globais tais como os contextos socio-económico, político e institucional, sem ignorar os problemas e prioridades nacionais. A TDA deve ser uma avaliação objectiva, baseada na melhor informação científica e técnica disponível, e é compilada através de consultas exaustivas com todos os grupos de interesse.