На шестой Межправительственнрй Встрече страны-участницы NOWPAP договрились создать Региональный Координационный Орган (РКО) в Тояме (Япония) и Пусане (Корея). Инаугурация офисов РКО была проведена в ноябре 2004 г. До этого момента координация NOWPAP оцуществлялась из штаб-квартиры ЮНЕП в Найроби (Кения).
РКО – это «нервный центр» NOWPAP, направляющий деятельность Региональных Тематических Центров и выполнение других проектов Плана действий. РКО отвечает также за выполнение решений, принятых на МПВ и поддерживает связи с другими программами и организациями, работающими в северо-западной части Тихого океана.