بالتعاون مع المنظمة الإسلامية للتربية والعلوم والثقافة ((ISESCO، نظمت الهيئة الإقليمية للمحافظة على بيئة البحر الأحمر وخليج عدن ورشة عمل تدريبية حول "منهج النظام البيئي لإدارة الموارد السمكية" خلال الفترة 12-14 أكتوبر 2009 ، وذلك بمقر الهيئة الرئيسي بمدينة جده. وشارك بالتدريب في الورشة د. ديريك ستابلز (أستراليا) ود. أحمد خليل (برنامج الموارد البحرية بالهيئة)، وحضر الورشة متخصصون من إدارات الأسماك والبيئة البحرية من دول الهيئة (الأردن، جيبوتي، مصر، السعودية، السودان، واليمن) ومن دول أخرى أعضاء في الآيسيسكو (البحرين وعمان وإيران).

شمل برنامج الورشة ثلاث مكونات رئيسية هي: أسس وتطبيقات منهج النظام البيئي في إدارة الموارد السمكية، تقييم الأنشطة والممارسات الحالية فيما يتعلق بمنهج النظام البيئي، تدريبات عملية على تطبيق منهج النظام البيئي بمراحله المختلفة التي تشمل تحديد مدي النظام البيئي، وتعريف القضايا وتحديدها، وتحليل المخاطر وترتيب الأولويات، وتحديد الأهداف ورسم إستراتيجيات الإدارة  وقياس الأداء والرصد. وقد خصصت الجلسة الختامية لمناقشة وتطوير إطار عام لخطة عمل إقليمية لتطبيق منهج النظام البيئي في إدارة الموارد السمكية في البحر الأحمر وخليج عدن.