| 第6回政府間会合においてNOWPAP参加国は、日本・富山と韓国・釜山に地域調整部（RCU）の事務所を共同設置することに原則として合意しました。翌第7回政府間会合で、富山・釜山両事務所の業務分担について参加国が合意し、RCU富山・釜山事務所が2004年11月に設立されました。RCUが設立されるまでは、ケニヤ・ナイロビにあるUNEPの地域海担当部局が暫定事務局を務めていました。
RCUは、NOWPAPの活動を指揮、推進する中枢機関であり、NOWPAPの活動に関して参加国が決定したことを実行に移すための責任を有します。RCUは、地域活動センター（RAC）と緊密に連絡を保つと共に、RACの活動を支援します。他の国際機関と協力関係を築いていくこともRCUの重要な任務の1つです。
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